Ενυδρειοπονία είναι η διαδικασία με την οποία αρχίζει η τροφοδοσία του ψαριών τα οποία παράγουν απόβλητα πλούσια σε αμμωνία, η οποία συσσωρεύεται στο νερό. Στη συνέχεια το «πλούσιο» σε απόβλητα νερό που είναι απαραίτητο για την ανάπτυξη των φυτών αντλείται στους θαλάμους καλλιέργειας των φυτών. Μέσα στους θαλάμους καλλιέργειας υπάρχουν βακτήρια τα οποία μετατρέπουν την αμμωνία σε άζωτο που είναι το βασικό στοιχείο στην θρέψη των φυτών. Οι ρίζες των φυτών φιλτράρουν το νερό το οποίο περιέχει πλέον θρεπτικά στοιχεία για τα ψάρια, και αντλείται πίσω στα ψάρια.